粪菌移植过于粗放，精准调菌有5招

的步骤相较[8-9]，适用MB097似乎更是具系统性和有效性。

Robinson 宣称，与在短时间内有效的 FMT 药物不同，MB097 可以通过每天给药剂，将有益寄生虫一直保有在高沸点水平。他的一个团队蓝图在 2023 年顺利进行一项流行病学I期实验，将 MB097 与抗 PD-1 联用，用做疗程六个月内免疫疗程无效的更早黑色素瘤病征。

Robinson 知道，对于这些病征，“我们期盼必须彻底改变他们哮喘的持续发展轨迹”。

随心所欲3:CRISPR基因总编辑电子技术

其他研究工作一个团队则倾向于避免似乎毁坏十二指肠菌种一组微妙均衡的犯罪行为，除此以外引入或去除寄生虫种群。

集团总部设于布鲁塞尔的 Eligo Bioscience 新公司对更是温和的步骤感兴趣。该新公司专为从事基因疗程步骤的研究工作，通过工程噬菌体衣壳向十二指肠菌种给予 DNA 有效载荷。当很强疗程充分发挥作用的 DNA 有效载荷到约索科利夫卡，它们会使有害基因失效或使疗程关的酵素方才隐含。

该新公司的主要电子技术开发项目是 EB003。这是一种噬菌体共通的碳纳米管胶体，经过工程外观设计，可附着在隐含三木蛇毒的肠出有血性菌株 O157:H7 上。这种菌株隐含的蛇毒会毁坏十二指肠内壁，导致血性腹痛。5 岁此表的儿童尤其更易遭受这种传染，高约 15% 的病征会持续发展为似乎危及生命的溶血性尿毒症综合征[10]。

当工程化碳纳米管胶体接触到肠出有血性菌株 O157:H7 后，其会输送一批编码 CRISPR-Cas 核糖核酸的 DNA 和可视的借助 RNA，使两个隐含三木蛇毒的基因失效，从而逃跑该寄生虫。

EB003 在经隐含三木蛇毒的菌株传染的猫建模之前顺利进行了测试。接纳了 EB003 疗程的猫的传染持续时间微小短于接纳缓冲液疗程的对照一组。

Eligo Bioscience 副总裁生物学官 Edith Hessel 哈佛大学推论知道：“EB003 可以缓解腹痛的征状，特别是在加快上皮细胞的恢复飞行速度，并阻止蛇毒的拘押。”

在 Hessel 哈佛大学看来，EB003 展出了选择性彻底改变菌种群的优势。她推论知道：“你不仅不想逃跑（有害的）寄生虫，你还要以一种极为特殊的形式逃跑它，以保持其他菌株完好无损。”

随心所欲4:“操控”菌种一组的活性

Enterome 新公司打算采用十分相似的更是加温和的步骤来彻底改变十二指肠菌种一组。这家集团总部设于布鲁塞尔的新公司的一个一个团队打算专注于寻找十二指肠寄生虫激素的小蛋白，这些蛋白与生命体细胞因子或激素一样，可以冲击十二指肠和其他地方的环境因素过程。

Enterome 新公司的一个项目与溃疡性肝硬化有关，这是一种时有发生在结肠和直肠内壁的水肿。为了后退这项蓝图，该新公司的生物学家决定寻找必须人为正向十二指肠吞噬细胞激素红血球羟基丁酸 -10 的酵素。红血球羟基丁酸 -10 是一种有效的免疫调节细胞因子，很强抑制水肿的充分发挥作用。

该新公司拥有一个“十二指肠寄生虫激素小蛋白”检索，这一检索相关联了约 2 万个来自数千人的十二指肠菌种一组的小蛋白数据资料。Enterome 新公司的生物学政府部门经理 Grégoire Chevalier 哈佛大学推论知道：“该检索可以用来筛选出有必须在体外正向生命体单核细胞激素红血球羟基丁酸 -10 的酵素。”

生物学家发掘出最有效的酵素是 EB1010。在溃疡性肝硬化大鼠和活体建模之前，无论是这样一来在结肠内适用 EB1010，还是制剂给药剂，研究工作小一组都观察到：与接纳常规疗程的哺乳类相较，在适用 EB1010 疗程后，水肿；也和十二指肠溃疡的时有发生率均降低。

“在这两种建模之前，我们都能看到极为好的疗效。”Chevalier 哈佛大学知道。

Enterome 新公司蓝图在 2023 在此之前积极参与 EB1010 对轻之前度溃疡性肝硬化疗效的1期流行病学实验。Chevalier 哈佛大学建议通过制剂药剂片的形式将 EB1010 这样一来注入十二指肠，以克服之前通过注射红血球羟基丁酸 -10 疗程某些水肿性肠病的理应，因为这种短期细胞因子需要局部高沸点才能充分发挥充分发挥作用。

他补充知道：“我们只是在努力利用我们的菌种一组和环境因素学之间仍未存在的人为相互充分发挥作用。”

随心所欲5:搭救“失败”的药剂物

菌种一组还可以与药剂物开发设计成为“合作伙伴”的关系。也就是知道，在流行病学实验之前，菌种一组可作为界定强劲声势浩大者和偏声势浩大者的生物；也。这种生物标记物甚至可以用来识别系统病征亚群，识别系统出有可以得益的病征亚群。简言之，对菌种一组的深厚关注可以挽救“失败”的药剂物。

设于加利福尼亚州、专为开发设计癌症病症应用软件的 Micronoma 新公司打算揭示这种似乎性。该新公司的“菌种一组驱动的固体活检”电子技术可以认定出有精子之前与不同癌症类型关的的菌种遗传物质的特质[11]。

Micronoma 新公司副总裁副总裁、药剂学哈佛大学 Sandrine Miller Montgomery 说明有，这些特质菌种有许多来自于肿瘤一组织，并在一组织更是新过程之前流入了精子之前。但奇怪的是，其之前也有一些来自双腿的其他臀部。

Micronoma 新公司的生物学家打算研究工作这种步骤在确定癌症病征对疗程声势浩大各个方面的效用。有效的药剂物似乎会彻底改变肿瘤的微环境，进而冲击其微生态系，从而在精子之前造成必须界定有质子化和无质子化病征的特质。

这些特质可以用来比对在结果失败的流行病学实验之前，对给定疗程有质子化的病征群体。为此，该新公司正蓝图积极参与研究工作，对流行病学实验前捕获的精子样本顺利进行回顾性比对，以寻找以前质子化信号。这些研究工作似乎会导致“失败”的药剂物被用做这类病征亚群。

根据 Miller Montgomery 的知道法，Micronoma 新公司的电子技术可以作为“精确的流行病学实验外观设计应用软件”，也就是知道，它检验到的菌种特质可以用做辅助病症。

总的来知道，了解到这些菌种特质及其背后的前提，最终似乎会造成属于自己药物。Miller Montgomery 强劲调：“我们需要忠告大家，菌种并不会适应我们，相反地，我们需要适应菌种。”

参考文献：

1. U.S. Food and Drug Administration. Important safety alert regarding use of fecal microbiota for transplantation and risk of serious adverse reactions due to transmission of multi-drug resistant organisms. Published June 13, 2019. Updated December 4, 2020. Accessed March 1, 2022.

2. Guo Z, Zhang J, Wang Z, et al. Intestinal microbiota distinguish gout patients from healthy humans. Sci. Rep. 2016; 6: 20602. DOI: 10.1038/srep20602.

3. Chu Y, Sun S, Huang Y, et al. Metagenomic analysis revealed the potential role of gut microbiome in gout. NPJ Biofilms Microbiomes 2021; 7: 66. DOI: 10.1038/s41522-021-00235-2.

4. Larkin J, Chiarion-Sileni V, Gonzalez R, et al. Five-Year Survival with Combined Nivolumab and Ipilimumab in Advanced Melanoma. N. Engl. J. Med. 2019; 381: 1535–1546. DOI: 10.1056/NEJMoa1910836.

5. Matson V, Fessler J, Bao R, et al. The commensal microbiome is associated with anti-PD-1 efficacy in metastatic melanoma patients. Science 2018; 359(6371): 104–108. DOI: 10.1126/science.aao3290.

6. Frankel AE, Coughlin LA, Kim J, et al. Metagenomic Shotgun Sequencing and Unbiased Metabolomic Profiling Identify Specific Human Gut Microbiota and Metabolites Associated with Immune Checkpoint Therapy Efficacy in Melanoma Patients. Neoplasia 2017; 19(10): 848–855. DOI: 10.1016/j.neo.2017.08.004.

7. Robinson MJ, Vervier K, Harris S, et al. Precision microbiome profiling identifies a novel biomarker predictive of Immune Checkpoint Inhibitor response in multiple cohorts and a potent therapeutic consortium of bacteria. Abstract presented at: American Association for Cancer Research Annual Meeting; Apr 10–15 and May 17–21, 2021; Philadelphia, PA. Cancer Res. 2021; 81(13_Suppl.): Abstract 1783. DOI: 10.1158/1538-7445.AM2021-1783.

8. Baruch EN, Youngster I, Ben-Betzalel G, et al. Fecal microbiota transplant promotes response in immunotherapy-refractory melanoma patients. Science 2021; 371(6529): 602–609. DOI: 10.1126/science.abb5920.

9. Davar D, Dzutsev AK, McCulloch JA, et al. Fecal microbiota transplant overcomes resistance to anti-PD-1 therapy in melanoma patients. Science 2021; 371(6529): 595–602. DOI: 10.1126/science.abf3363.

10. National Organization for Rare Disorders. STEC Hemolytic Uremic Syndrome. Accessed March 1, 2022.

11. Poore GD, Kopylova E, Zhu Q, et al. Microbiome analyses of blood and tissues suggest cancer diagnostic approach. Nature 2020; 579(7800): 567–574. DOI: 10.1038/s41586-020-2095-1.

原文链接：

编者｜Katarina Zimmer

解释器｜何狐狸

审校｜617

总编辑｜豫小鱼

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